Ранее в качестве тренера он работал в «Амуре» в сезоне-2010/11, а также в «Ладе» с 2006 по 2012 годы. В качестве игрока Нестеров с 1992 по 2005 годы также выступал за тольяттинцев, выиграв два чемпионата страны (1994, 1996).